Действие сериала и манги происходит в мире альтернативного средневековья. В этом мире люди сосуществуют с оборотнями — ёма, питающимися человеческим мясом.
Принимая облик своих жертв, ёма могут скрываться среди людей. Кроме того, съев мозг человека, чудовище может завладеть его воспоминаниями, становясь, таким образом, практически неотличимым от него. С целью борьбы с ёма безымянная тайная Организация создала орден могучих воинов, получивших прозвище «клеймор» из-за своих огромных двуручных мечей. Процесс создания клеймор подразумевает введение в человеческий организм крови и плоти ёма. В результате на свет появляются полулюди-полумонстры, которые сильнее и зачастую умнее чистокровных ёма. Эти полукровки способны чувствовать ёма, принявшего человеческое обличье. Город, чье население страдает от набегов ёма, может направить запрос в Организацию с просьбой убить монстров, орудующих на его территории. Приняв запрос, Организация посылает туда клеймор, и в случае успешного убийства ёма представитель Организации забирает у горожан плату. Каждая клеймор приобретает способность использовать ёки — силу, используемую ёма для превращений и прочих сверхъестественных действий. Используя силу ёма, клеймор постепенно утрачивает свою человеческую природу и может превратиться в чудовище страшнее любого обычного ёма. Этот процесс называется Пробуждением. Как правило, клеймор предпочитает смерть Пробуждению; для этого она посылает одной из своих соратниц так называемую Чёрную Карту — просьбу об умерщвлении. Если же клеймор пробуждается, она теряет последние остатки человечности и превращается в хищника, обладающего разумом, но желающего только убивать.
Слова — это то, за что прячутся слабые и за что умирают сильные.
Клэр — это имя богини любви, которая была воплощением чистоты. У нее была сестра-близнец по имени Тереза. Может быть нам дали такие имена, чтобы мы выросли похожими на богинь. Не плачь, Клэр. Любовь твоих родителей всегда будет жить в твоем имени...
Ты права. Может быть я и монстр, о котором ты говоришь, но рождена была я человеком, жила как человек, и умереть хочу как человек. Вот единственная правда для меня.
Тебе следует жить как человек, с людьми. Такую жизнь, как здесь, я никогда не смогу тебе предложить. Расти как человек, жить как человек и умереть как человек — это на самом деле величайшее счастье, которое может быть.
Разве люди оплакивают коров, свиней, овец, которых употребляют в пищу? Вовсе нет. Для них в этом нет ничего противоестественного, ведь животные не принадлежат к их виду. Таковы уж законы природы. Они логичны.
Мы с тобой были свидетелями одних и тех же событий. Но каждый из нас решил по-своему: продолжать бороться дальше или отступить... Наверное, этот выбор зависит от того, есть у тебя способность сражаться или нет.
— Что все это означает, Тереза?
— Ничего заумного. Причина очень проста и ясна. Я нашла цель в жизни, с этого момента я собираюсь жить ради этой девочки.
Я слуга господа, а все, о чем я думаю, — это о спасении собственной жизни. А полумонстр, богохульный убийца, кому запрещено входить в этот город, беспокоиться о мальчишке больше, чем о своей жизни.